《口袋妖怪3》采用6V6的卡牌对战，搜集各种经典的数码兽到自己队伍征战数码世界。
    玩家在数码世界各种玩法中获得各种道具装备强化自己的数码兽，数码兽可以被升级、进阶、觉醒，同样数码兽可以穿戴各式各样的装备，穿戴强化过后的装备会使得数码兽的战斗力大大加强。在这过程中也有机会搜集各种各样更加高级强大的数码兽，强大的数码兽拥有更加强大酷炫的技能，不同类型的数码兽隶属于不同的阵营，同阵营有羁绊的数码兽一起上阵更是会所向披靡。
    除开主线副本，玩家还可以参与到各种挑战、PVP玩法中，例如本服务器的竞技场，与本服务器的其它玩家决一高下；挑战一层又一层的黑暗之塔，赢取丰厚的奖励，又或者去密境寻宝赢取丰厚资源。