本作的主人公与《合金装备3》相同，是美国的传奇英雄Big Boss，《合金装备 和平行者》是《合金装备》系列的正统续作，游戏的时间背景为《合金装备3》的10年后、《合金装备5原爆点》的1年前，也就是1974年，地点则是中美洲的哥斯达黎加——佣兵部队“MILITAIRES SANS FRONTIERES”（无国界之军/无界之师）的所在地。
本作加入了三种控制方式，具体的大家在玩到之后应该就能了解到了。此外，敌人的AI和行动也进行了修正，CQC（近身格斗）方面也作出了不小的变动，总体来说就是使玩家更容易上手了。